Long time, no see

Vi ber om ursäkt för att bloggen legat i träda i en månad, det har varit en hektiskt månad där allas projekt utkristalliserats tydligare och en massa jobb plötsligt dök upp. Sedan senast har våren kommit till Merced på allvar, och vi har oftast 20-25 grader varmt med sol, om vi har tur upp till 30 grader. Tur att området vi bor på har pool!

Daniel och Sara har denna månad tillbringat mycket tid stint stirrandes på sina datorskärmar och svärandes över script som inte gör vad de förväntas göra. Jonna har varit instängd på labbet och svettats över protokoll som funkar för nästan allt, utom just det hon vill göra förstås. Förhoppningsvis lossnar det för alla snart.

April kommer bli en hektisk månad på det sociala planet. Idag landade Helena och Anna och ankommer till Merced ca 20.45 för några dagar i staterna. De anlände lite tidigt till San Francisco, men Anna skrämde nästan vettet ur Jonna med ett samtal med urusel mottagning, de enda ord som hördes var: Syster, problem, tullen, Kalles kaviar... Som tur var gick allt bra och de fick komma in i landet.

Nästa vecka ska den svenska delegationen först åka till San Francisco och shoppa lite med Anna och Helena innan de åker hem, sen snabbt tillbaka till Merced, packa om och åka till Las Vegas!

Knappt hinner vi hem förrän vår kamrat, Ingemar, kommer på besök. Tillsammans ger vi oss av till Wine Country för en weekend med vinprovning!

San Francisco

Den svenska trion besökte, som många vet, San Francisco förra helgen och här kommer äntligen några rader och bilder om och från utflykten.

Efter en ganska bekväm och händelsefattig tåg- och bussresa från lilla Merced till den stora staden vid Stilla havet så välkomnade San Francisco oss på lördageftermiddagen med regn. Ganska mycket av den varan också, vilket gjorde att när vi väl checkat in på våra hotellrum, som förövrigt var otroligt mycket bättre än vad vi förväntat oss, så gick vi bara tvärs över gatan för att fixa middag och sen stannade vi på hotellet resten av kvällen. Vilket gjorde att vi tyvärr missade det kinesiska nyåret som firades in bara några kvarter bort. Vi mötte upp med vår fjärde svensk, Carolin, som landade i USA på lördagskvällen, och gick och lade oss tidigt. Vilket var tur eftersom söndagen var betydligt mer aktiv och regnfri.

Vi gick upp tidigt och begav oss mot Chinatown med Chinatown-gate som är en av de stora turistattraktionerna, syns i bilden ovan. Eftersom det var nyårsdagen där så var det väldigt mycket folk ute och det fanns marknadsstånd från de flesta stora företag på plats. T.ex. så såg vi reklamskyltar för McDonalds på kinesiska. Efter att ha promenerat bland konstiga matbutiker och souvenirbutiker med otroligt mycket krims-krams, så riktade vi in oss mot stadens nästa turistställe, Fishermans Wharf, färjehamnen i stadens nordliga del. Där fanns det en massa restauranger av olika slag, men också färjeförbindelser till bland annat Alcatraz som man kan se från hamnen.

Vi beslutade oss för att åka över dit nästa gång vi är i San Francisco, och istället hoppade vi på en buss mot den berömda bron, som ni förhoppningsvis känner igen från bilden. Det soliga, men blåsiga vädret tillät oss att promenera ut en bra bit på bron, mer bilder kommer finnas på detta längre fram för dom som vill se, men vi begav oss snart vidare mot San Franciscos stora park, Golden Gate Park, kallad för 'the Park' av infödingarna(på samma sätt som Golden Gate-bron kallas för 'the Bridge'). Väl av bussen vid parken, så gick vi snabbt vilse i den fyra kvadratkilometer stora parken(större än Central Park i NY). Efter att ha insett att den här parken krävde en heldag så tog vi oss en fika på ett av museerna och begav oss mot våra hemkvarter istället.

Vårt hotell låg inte bara nära Chinatown utan också nära Union Square, San Franciscos centrala torg, där det stora shoppingstråket ligger. Efter någon timmes shoppande i lyxbutikerna runt torget stupade fyra trötta svenskar i säng.

På måndagen tog vi oss till busstationen för att lämpa av Carolins stooora väska och för att slå ihjäl dom sista timmarna innan vi skulle åka hem så gick vi runt i butikerna och saluhallen i slutet av Market Street. Måndagen slutade med att vi efter ännu en händelselös tåg- och bussresa gick och handlade saker till Carolins hem för de närmsta tio veckorna. Och därefter sömn.

Planering, programmering och pizzor

Nu är det ett tag sedan något skrevs på bloggen och det beror mest på att vi senaste veckan haft fullt upp med vårt programmeringsprojekt som ska vara inne på fredag. Idag stannade vi hemma för att ta hand om de sista små buggarna i programmet och själva dokumentationen. Det ser ut som att vi kan skicka in projektet ikväll efter att vi ätit våra pizzor som vi precis kommit hem med.

Utöver programmeringen så har Daniel och Jonna fått lite mer kontroll över planeringen för deras exjobb. Det blir provinsamling och sterilisering av proverna nästa onsdag. Fram till dess fortsätter deras arbete med den sekvensdata som skickats från Finland. Datan är i form av kortare sekvenser som sätts ihop till längre sekvenser i ett datorprogram och därefter kan dessa sekvenser jämföras med redan existerande sekvenser för att hitta släktskap med andra mikroorganismer. Själva arbetet går mest ut på att skriva kortare programrader för att behandla sekvensdatan på olika sätt och därefter köra in resultatet i diverse program för att i slutändan få ut en datafil som ser ut på ett specifikt sätt och då kan jämföras med andra datafiler som är uppbyggda på samma sätt. Hittills verkar deras resultat lovande.

För Saras del har det också blivit lite mer planering och just nu försöker hon få ordning på programmeringsspråket Perl för att kunna arbeta med sina datafiler. Så det blir mycket datorer för alla tre just nu.

Utöver själva arbetsplaneringarna så har vi också planerat in att åka till San Francisco i helgen för att möta upp den fjärde svensken som kommer på lördag eftermiddag. Vi kommer åka till San Francisco på lördag morgon och stanna där två nätter eftersom måndagen är en röd dag. Vi hittade ett litet hostel som har dubbelrum och ligger mitt i San Franciscos downtown. Planer för vad som ska göras i San Francisco har också gjorts. Alcatraz, China Town och Fisherman's Wharf ligger väldigt bra till just nu. Och givetvis bron.

Mer om San Francisco blir det nog i nästa inlägg och troligtvis några bilder också.

Datorarbete och amerikansk fotboll

Den stora helgen(alltså den stora efter jul och thanksgiving) var i helgen. Det är givetvis Superbowl, finalen i vad amerikanerna något felaktigt kallar football, det handlar om. Söndagen då allt annat står stilla och alla tittar på matchen. Eller reklamerna som visas under matchen. Eller pausunderhållningen mitt i matchen. För oavsett om man är intresserad av sporten eller inte, så finns det något att titta på. Hela upplevelsen var som att en flod av kommersialism rann från TV-skärmen. De korta spelmomenten avbröts av reklam för allt möjligt och såvitt vi kan förstå så har en av reklamerna fått mer uppmärksamhet än de övriga. Och det var inte på grund av att den var extra rolig eller bra utan för att det var en två minuter lång ogenerad hyllning till gamla värden om vad USAs industri egentligen står för presenterad av Eminem som så många gånger tidigare vägrat ställa upp i reklamer. En biltillverkare i rapparens hemstad, Detroit, hostade upp något bisarra 62 miljoner kronor för att synas i två minuter när hela landets befolkning tittade. Det finns säkert massvis med smarta företagsekonomer som kan komma med fina teorier om varför det var helt rätt att göra så, men kritiken lät inte vänta på sig. Varför lägga så mycket pengar på en reklam som inte handlar om en specifik produkt man vill sälja när man samtidigt får skära ner i arbetsstyrkan?

Själva matchen blev väldigt spännande och tillslut stod fans-ägda Green Bay Packers som vinnare och det rika storlaget Pittsburg Steelers var besegrade. Själva var vi fullproppade med pizza och öl och hade mest suttit och snackat om en massa andra grejer med våra amerikanska vänner. En bra söndag helt enkelt.

För Jonna och Daniels del så har examensjobbet kommit igång lite. DNA-sekvensen för den nya bakterien har anlänt från Finland och ett program som ska pussla ihop de ca 50000 kortare sekvenssnuttarna har installerats och testats. Resultatet blev strax under 4000 längre sekvenser som nu ska vridas och vändas på till något vettigt kommer ut. En hel del datorarbete istället för att sitta ute i solen alltså.

Internet, dammsugning och skejtande professorer

Det har gått några dagar sen senaste uppdateringen och det beror mest på att vi äntligen har flyttat in i vår lägenhet med allt vad det innebär och det faktum att det tydligen krävs mer än tre ingenjörer för att få en router att fungera, så vi har varit utan internet. Fram till igår då fantastiske Josh kom över och blängde argt på den i ca 45 minuter. Nu fungerar allt igen och förhoppningsvis betyder det att det kommer mer kontinuerliga uppdateringar här på bloggen.

Vi har också lyckats införskaffa grejer till lägenheten, bland annat tallrikar, bestick, klädhängare och annat man tar för givet. Däremot har vi fortfarande inte en enda möbel som är designad för att sitta på, men förhoppningsvis kommer det ändra sig till helgen. Vi har dock skaffat en fin, röd dammsugare vid namn Dirt Devil, så nu kan lägenheten åtminstone bli ren och Jonna har fått tag på en minneskortsläsare så att det kommer bli lite mer bilder här på bloggen. T.ex. nämnda Dirt Devil.

När det gäller själva projektet vi är här för att göra så har vi fått ca tjugo vetenskapliga papper att läsa in oss på vilket är veckans projekt. Nästa vecka kommer förhoppningsvis datan från Finland så vi kan börja titta på den och planera själva labbdelen.

Vi har också fortsatt gå på Daves föreläsningar och i måndags dök han upp med en skateboard i handen. Det visade sig att både han och hans fru, vår handledare, åker longboard så ofta dom kan. Så uppenbarligen har vi två skejtande professorer. Vi hade gärna velat se Leif Abrahamsson eller Anders Virtanen åka longboard, men det kan vi nog glömma. Nu har dock Daniel blivit sugen på att ta upp skateboardandet igen, men det kan mycket väl vara en 30års-kris.

Själva innehållet i Daves kurs är än så länge på en sådan nivå att vi inte har några problem alls att hänga med trots att vi samtidigt ominstallerar operativsystem och svarar på inlämningsuppgifter, som vi egentligen inte behöver göra, på föreläsningarna. Resten av kursarna verkar inte alls ha det lika lätt. Specifikt filsystems uppbyggnad verkar vara svårt för många.

Anledningen till att vi är här

Igår hade vi möte med vår handledare, Carolin, och de två doktoranderna i hennes grupp, Alyssa, som vi bott hos en vecka nu, och Emily, som vi träffade för första gången igår. Dom gick igenom vad deras forskningsgrupp håller på med och sen diskuterade vi våra projekt med Carolin. Inte helt oväntat så kommer vi få skriva om våra projektplaner lite eftersom saker och ting har ändrats. Som tur var till det bättre. Carolin samarbetar med en forskargrupp i Finland och nyligen har den forskargruppen upptäckt vad dom tror är en ny bakterie som lever i symbios inuti tallar. Den finska forskargruppen vet dock inte vad dom ska göra med den här bakterien, så dom vill att Carolins grupp ska arbeta med den och Carolin tycker att det vore ytterst lämpligt att vi fick göra våra examensjobb på den här bakterien. Vi tycker också att det är en bra idé. Carolin anser dock att det vore bra om vi publicerar "ett par" papper under dom här fem månaderna, något vi är lite oroliga inför, men det är ju bra med höga mål. Vi får helt enkelt se hur det går.

Imorgon är det inflytt i lägenheten, så vi har en del grejer att ta itu med idag, så vi ska ut med en av Daves doktorander, Julie, och köpa mobiltelefoner, täcken, kuddar och lite husgeråd. Troligtvis får vi skaffa en luftmadrass som Jonna och Daniel kan använda närmsta veckan och sen beställa riktiga madrasser från Walmart. Annars verkar det som att, som vi skrivit tidigare, att Julie och Katie har i princip allt vi behöver i sina garage.

Föreläsning och lägenhet

Igår var vi på föreläsning i bioinformatik, en kurs som vår handledares make föreläser. Delar av den verkar lite väl grundläggande för oss, men andra delar kan nog vara bra att gå igenom igen, t.ex. UNIX, Perl och maskininlärning, så vi frågade om vi kunde gå på föreläsningarna hela terminen trots att vi inte är inskrivna. Eftersom Dave, föreläsaren, verkar gilla att det finns några i klassen som faktiskt kan grunderna när det gäller datorer, programmering, matematik, statistik och biologi, så var det inga problem alls. Och vår handledare tycker att det är bra för oss att lära oss mer av sånt till projektet, så hon har inget emot att vi lägger några timmar i veckan på kursen istället för projektet.

Själva föreläsningen var mest en demonstration av hur man installerar en dual boot med Ubuntu och konfigurerar OS:et, något som visade sig vara väldigt lätt och vi blev alla klara på under en timme. Vilket var tur för vi var tvungna att åka iväg till fastighetskontoret för att lämna in alla papper till lägenhetsansökningen. Det visade sig inte vara några problem alls för oss att bli godkända, så vi flyttar in i vår alldeles egna trea på söndag.

Något som visade sig vara problematiskt däremot är att synka det svenska banksystemet med det amerikanska. Tydligen vill dom här att man betalar sin hyra och sin deposition med check eller något som kallas money order. Money order är något man kan skaffa i livsmedelsbutikers förbutiker och funkar precis som checkar, men man behöver inget checkkonto. Daniel försökte fixa en money order för depositionen på lägenheten och betala den med sitt visa-kort, men det fungerade inte. Nu försöker vi få hjälp via mail från banken i Sverige för att lista ut hur vi ska göra för att kunna betala vår hyra. Troligtvis måste vi ta ut kontanter och sen betala en money order, men det kanske finns ett smidigare sätt(rykten säger att Swedbank samarbetar med Citybank här i staterna, så vi kanske kan fixa på deras kontor). Vi ska i vilket fall som flytta in på söndag och just nu verkar det som att vi inte behöver köpa speciellt mycket grejer till lägenheten då alla doktorander i gruppen verkar ha garaget fullt med köksgeråd, soffor, stolar och annat smått och gott. Alla är väldigt snälla, vi är inte helt säkra på hur det här hade gått om vi inte fått all den här hjälpen.

Första dagen på jobbet

Nu har den första arbetsdagen börjat(måndagen var Martin Luther King-day och därför en röd dag) och vi har hittills fått var sitt skrivbord, fått fylla i en pickup-last med papper och träffat våra handledare. Att ta sig till universitetet var ganska lätt med buss(och billigt för oss som är vana vid att åka buss i Uppsala) och busschaffisen hälsade alla som steg på med frasen "Go Bobcats!" vilket muntrade upp oss i dimman. Bobcat är universitetets maskot och vi har kommit överens om att vi måste dels besöka studentradiostationen, Bobcat radio, och dels något sportevenemang där Bobcats krossar Wild dogs eller något annat djur.

Appropå djur så hade vi vårt första möte med den lokala faunan igår. När vi satt och spelade TP med Alyssa, Stephen och Casey efter middagen, så fick Sara syn på ett par stirrande ögon genom altandörren. Det visade sig vara en extremt söt opossum som helt ogenerat tittade in på oss. Alyssa var inte alls lika glad som vi, utan tyckte att det var ett äckligt odjur som borde jagas bort.

Nu börjar det närma sig lunch som vi ska inta tillsammans med våra handledare Carolin och David och senare i eftermiddag börjar den stora jakten på någonstans att bo och kanske en stadskarta så man kan börja lära känna staden ordentligt.

Dag 1, hittills

Vi glömde skriva om en rolig detalj som hände under resan hit. Anledningen till att vi glömde måste vara för att det känns som det var en vecka sedan vi gick genom första security checken på Arlanda. Givetvis var det Daniel som blev stoppad och genomsökt redan där. Men det roliga med detta var inte själva genomsökningen utan att det var Lidaw, från föreningen UNF som Daniel och Jonna suttit i styrelsen för, som genomförde nämnda genomsökning. Ett sista farväl från UNF såg vi det som.

Nu är vi på plats i Merced hos doktoranden Alyssa som vi ska bo hos till vi fixat eget boende. Det är ett trevligt hus i ett lugnt kvarter och vi har fått två egna rum, ett till Sara och ett till Jonna och Daniel. Vi har också träffat Alyssas fästman, Stephen, som är doktor i matematik och Alyssas bror Casey, som är freakishly bra på trummor i Guitar Hero.

Efter en snabb dusch strax efter ankomst gick vi på en rask promenad i 'hooden' och fick se en hel del gator som såg ut som dom var tagna direkt ur Desperate Housewifes. Daniel började nynna på låten från Weeds och Stephen stämde snabbt in. Uppenbarligen delar våra värdar vår typ av humor.

Vi har också hunnit med ett besök i Merced centrum där vi hann bli inbjudna till live-konserter i den lokala studentbokhandeln och lite lunch innan Daniel upptäckte något underhållande. Vissa bilar i USA har kombinationslås på dörren. Såna som vanliga människor har på sina resväskor.

Efter denna första upptäckt, som faktiskt lämnade oss lite perplexa, åkte vi till en matvarubutik för att inhandla lite frukost och där gjordes ännu en upptäckt. Det finns hur många varianter på mjölkfri ost som helst i USA. Daniel är väldigt nöjd med läget.

Ikväll är vi bjudna på middag och drinkar på stan. Då får vi träffa fler infödingar.

Hello San Francisco, hello jet-lag!

Vi har nu landat i San Francisco 23.00 lokal tid(8.00 svensk tid) efter en lång dag. Det började i morse med att Daniel hade blivit utvald att få genomgå en specialkontroll innan han fick gå på planet(kan det varit skägget och hårfärgen?). Under själva resan till New York så hanns det med ett antal filmer, många boksidor och en hel del irriterande av varandra.

I New York fortsatte Daniels tur. Vid tullen, där man ska lämna fingeravtryck och fotograferas, så la deras datorsystem av precis när det var hans tur(Jonna och Sara hade redan kommit igenom). En halvtimmes väntan och en pratstund med den trevlige tulltjänstemannen senare så kunde vi alla tre hämta ut vårt bagage. Gissa vems nya väska som hade gått sönder...

Nåväl efter sex timmars väntan på Newark fick vi äntligen gå på planet till San Francisco där vi nu är efter en händelselös sista sträcka.

Nu väntar mer väntan på att Alyssa ska komma och hämta oss om ca sex timmar. Sovdags alltså.

Första intrycket är att amerikaner har lätt till skratt och är väldigt trevliga att ha och göra med. Hoppas det fortsätter så här.

Vad är detta?

Jo, det här är tre civilingenjörsstudenter från Uppsala som gör sina examensarbeten i den lilla staden Merced i Kalifornien, USA. Det troligaste är att du hamnat här efter att du fått en länk från någon av oss och därför känner en, två eller alla tre av oss. Om du hamnat på den här bloggen på något annat sätt och alltså inte känner någon av oss, så är du ändå varmt välkommen att ta del av allt vi kommer skriva.

Men vad kommer bloggen innehålla då?

* En hel del bioteknik och bioinformatik. Om du inte förstår, bryr dig eller helt enkelt tycker sånt är tråkigt, så kan du lätt hoppa över dom delarna.

* Tre studenters ångest över sina examensjobb, byråkrati och annat kul som kan drabba oss ekonomiskt handikappade. Vill du slippa höra gnäll, så kan du hoppa över dom delarna också.

* Två döttrar och systrar och en son och bror och tre vänners information till nära och kära som i vanliga fall träffar oss på regelbunden basis. Om du inte är släkt eller vän med oss, så kan du hoppa över den här delen också om du vill.

* Tre svenskars upplevelser och kulturkrockar i världens åttonde ekonomi. Har du redan upplevt allt som går att uppleva i Kalifornien(om det nu går), så kan du lätt hoppa över dom delarna också.

Det kommer säkert dyka upp en massa annat också, men det märker vi på vägen.

Just nu är det dagen innan avresa och det har redan hänt en massa grejer på vägen hit(visumproblem, problem med att skaffa boende och annat smått och gott) som vi helt enkelt hoppar över och går rakt in i det göttiga. Nästa inlägg kommer från det stora landet i väster.

Daniel, Jonna och Sara