Planering, programmering och pizzor

Nu är det ett tag sedan något skrevs på bloggen och det beror mest på att vi senaste veckan haft fullt upp med vårt programmeringsprojekt som ska vara inne på fredag. Idag stannade vi hemma för att ta hand om de sista små buggarna i programmet och själva dokumentationen. Det ser ut som att vi kan skicka in projektet ikväll efter att vi ätit våra pizzor som vi precis kommit hem med.

Utöver programmeringen så har Daniel och Jonna fått lite mer kontroll över planeringen för deras exjobb. Det blir provinsamling och sterilisering av proverna nästa onsdag. Fram till dess fortsätter deras arbete med den sekvensdata som skickats från Finland. Datan är i form av kortare sekvenser som sätts ihop till längre sekvenser i ett datorprogram och därefter kan dessa sekvenser jämföras med redan existerande sekvenser för att hitta släktskap med andra mikroorganismer. Själva arbetet går mest ut på att skriva kortare programrader för att behandla sekvensdatan på olika sätt och därefter köra in resultatet i diverse program för att i slutändan få ut en datafil som ser ut på ett specifikt sätt och då kan jämföras med andra datafiler som är uppbyggda på samma sätt. Hittills verkar deras resultat lovande.

För Saras del har det också blivit lite mer planering och just nu försöker hon få ordning på programmeringsspråket Perl för att kunna arbeta med sina datafiler. Så det blir mycket datorer för alla tre just nu.

Utöver själva arbetsplaneringarna så har vi också planerat in att åka till San Francisco i helgen för att möta upp den fjärde svensken som kommer på lördag eftermiddag. Vi kommer åka till San Francisco på lördag morgon och stanna där två nätter eftersom måndagen är en röd dag. Vi hittade ett litet hostel som har dubbelrum och ligger mitt i San Franciscos downtown. Planer för vad som ska göras i San Francisco har också gjorts. Alcatraz, China Town och Fisherman's Wharf ligger väldigt bra till just nu. Och givetvis bron.

Mer om San Francisco blir det nog i nästa inlägg och troligtvis några bilder också.

Datorarbete och amerikansk fotboll

Den stora helgen(alltså den stora efter jul och thanksgiving) var i helgen. Det är givetvis Superbowl, finalen i vad amerikanerna något felaktigt kallar football, det handlar om. Söndagen då allt annat står stilla och alla tittar på matchen. Eller reklamerna som visas under matchen. Eller pausunderhållningen mitt i matchen. För oavsett om man är intresserad av sporten eller inte, så finns det något att titta på. Hela upplevelsen var som att en flod av kommersialism rann från TV-skärmen. De korta spelmomenten avbröts av reklam för allt möjligt och såvitt vi kan förstå så har en av reklamerna fått mer uppmärksamhet än de övriga. Och det var inte på grund av att den var extra rolig eller bra utan för att det var en två minuter lång ogenerad hyllning till gamla värden om vad USAs industri egentligen står för presenterad av Eminem som så många gånger tidigare vägrat ställa upp i reklamer. En biltillverkare i rapparens hemstad, Detroit, hostade upp något bisarra 62 miljoner kronor för att synas i två minuter när hela landets befolkning tittade. Det finns säkert massvis med smarta företagsekonomer som kan komma med fina teorier om varför det var helt rätt att göra så, men kritiken lät inte vänta på sig. Varför lägga så mycket pengar på en reklam som inte handlar om en specifik produkt man vill sälja när man samtidigt får skära ner i arbetsstyrkan?

Själva matchen blev väldigt spännande och tillslut stod fans-ägda Green Bay Packers som vinnare och det rika storlaget Pittsburg Steelers var besegrade. Själva var vi fullproppade med pizza och öl och hade mest suttit och snackat om en massa andra grejer med våra amerikanska vänner. En bra söndag helt enkelt.

För Jonna och Daniels del så har examensjobbet kommit igång lite. DNA-sekvensen för den nya bakterien har anlänt från Finland och ett program som ska pussla ihop de ca 50000 kortare sekvenssnuttarna har installerats och testats. Resultatet blev strax under 4000 längre sekvenser som nu ska vridas och vändas på till något vettigt kommer ut. En hel del datorarbete istället för att sitta ute i solen alltså.